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1樓 [收藏(0)] [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-20 17:09 |只看該作者 |倒序?yàn)g覽
本帖最后由 gooderpan 于 2016-12-20 17:15 編輯

有一個(gè)文件file：（tab分隔）
CASP8        ID:841  Predicted
BIOSYSTEM:169493  377873  1269170  213780
BIOSYSTEM:1270288  1270261  1270287

PIK3CD        ID:5293  Predicted
BIOSYSTEM:1269171  169493  373889

FCAR        ID:2204  Predicted
BIOSYSTEM:153910  153859  With_TAP2
BIOSYSTEM:171867  153910
BIOSYSTEM:153910  153859  With_HLA-B
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
以每個(gè)基因?yàn)槊啃械拈_(kāi)頭，將后續(xù)每行接入其后面，想要得到的結(jié)果如下：
CASP8        ID:841  Predicted  BIOSYSTEM:169493  377873  1269170  213780  BIOSYSTEM:1270288  1270261  1270287
PIK3CD        ID:5293  Predicted  BIOSYSTEM:1269171  169493  373889
FCAR        ID:2204  Predicted    BIOSYSTEM:153910  153859  With_TAP2    BIOSYSTEM:171867  153910  BIOSYSTEM:153910  153859   With_HLA-B
請(qǐng)問(wèn)大神們，該怎么處理呢？？？謝謝啦！！

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2樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-20 17:21 |只看該作者

  1. awk NF=NF RS= file
復(fù)制代碼

?

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3樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-20 18:06 |只看該作者
  1. perl -00ne '@F=split(/\n/);print @F,"\n"' f
復(fù)制代碼

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發(fā)表于 2016-12-20 19:54 |只看該作者

  1. sed '/ID:/{:a;N;/\n\s*$/!{s/\n/ /;ta};P};D' file
復(fù)制代碼

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5樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-20 19:58 |只看該作者
  1. perl -00pe 's/\n(?!\z)/\t/g' f
復(fù)制代碼

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6樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-20 23:07 |只看該作者

  1. sed '/ID:/{h;d};H;$ba;/^\s*$/{:a;g;s/\n/ /gp};d' file
復(fù)制代碼

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7樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-21 00:03 |只看該作者
回復(fù) 5# sunzhiguolu
請(qǐng)問(wèn)大神，這個(gè)perl命令的含義是什么呀？？

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發(fā)表于 2016-12-21 01:07 |只看該作者
回復(fù) 7# gooderpan
perl -00pe 's/\n(?!\z)/\t/g' f

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9樓 [報(bào)告]
發(fā)表于 2016-12-21 01:07 |只看該作者
回復(fù) 7# gooderpan
perl -00pe 's/\n(?!\z)/\t/g' f

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發(fā)表于 2016-12-21 09:20 |只看該作者
  1. awk 'BEGIN{RS=""}{$1=$1;print}' file

  3. sed '/ID/{:a;N;/\nBIOSYSTEM/s/\n/ /;ta;P;D}' file
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