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[文本處理] 請(qǐng)教awk將一列轉(zhuǎn)為下面的兩列格式 [復(fù)制鏈接]

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1 [收藏(0)] [報(bào)告]
發(fā)表于 2013-12-09 20:37 |只看該作者 |倒序?yàn)g覽
本帖最后由 chenjiali1 于 2013-12-09 20:38 編輯

A文件如下所示:
ENSMUSG00000000001 190
ENSMUSG00000000001 153
ENSMUSG00000000002 129
ENSMUSG00000000003 128
ENSMUSG00000000003 157
ENSMUSG00000000003 141
ENSMUSG00000000004 42
ENSMUSG00000000004 117
ENSMUSG00000000004 87
ENSMUSG00000000004 2323

想要轉(zhuǎn)化成的文件如下所示:
ENSMUSG00000000001 0 190
ENSMUSG00000000001 191 343
ENSMUSG00000000002 0 129
ENSMUSG00000000003 0 128
ENSMUSG00000000003 129 285
ENSMUSG00000000003 286 426
ENSMUSG00000000004 0 42
ENSMUSG00000000004 43 159
ENSMUSG00000000004 160 246
ENSMUSG00000000004 247 2569
即A文件的第二列可以看成一個(gè)長(zhǎng)度,在B文件中給出數(shù)值區(qū)間,如第一行,190可以轉(zhuǎn)化為0 190, 第二行在190的基礎(chǔ)上加上153,就是343,這時(shí)候的起始數(shù)字為190+1,則這行為ENSMUSG00000000001 191 343,在計(jì)算的時(shí)候,根據(jù)第一列的不同,要分開(kāi)來(lái)算,如到了ENSMUSG00000000002,這里的129又重新定義為0 129.
請(qǐng)問(wèn)如何實(shí)現(xiàn),謝謝大家!

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2 [報(bào)告]
發(fā)表于 2013-12-09 21:19 |只看該作者
本帖最后由 sweettania 于 2013-12-09 22:57 編輯

awk '{if(!($1 in a)){a[$1]=$2;print $1,0,$2}else{print $1,a[$1]+1,a[$1]+$2;a[$1]+=$2}}' A

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3 [報(bào)告]
發(fā)表于 2013-12-09 23:18 |只看該作者
  1. awk '!a[$1]++{$3=$2;$2=0}$1==p{$3=q+$2;$2=q+1}{p=$1;q=$3}1'
復(fù)制代碼

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發(fā)表于 2013-12-10 10:11 |只看該作者
本帖最后由 li0924 于 2013-12-10 10:15 編輯

看看這個(gè)怎么樣?
  1. awk '{s=a[$1]++?e+1:0;e=b[$1]++?e+$2:$2;print $1,s,e}' file
復(fù)制代碼

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發(fā)表于 2013-12-10 10:18 |只看該作者
  1. [seesea@UC  ~]$ awk '{print $1, $1 in ar ? ar[$1]+1 : 0, ar[$1]+$2; ar[$1]+=$2}' A      
  2. ENSMUSG00000000001 0 190
  3. ENSMUSG00000000001 191 343
  4. ENSMUSG00000000002 0 129
  5. ENSMUSG00000000003 0 128
  6. ENSMUSG00000000003 129 285
  7. ENSMUSG00000000003 286 426
  8. ENSMUSG00000000004 0 42
  9. ENSMUSG00000000004 43 159
  10. ENSMUSG00000000004 160 246
  11. ENSMUSG00000000004 247 2569
復(fù)制代碼

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發(fā)表于 2013-12-10 10:19 |只看該作者
這樣就可以了,原來(lái)如此。
  1. [seesea@UC  ~]$ awk '{print $1, $1 in ar ? ar[$1]+1 : 0, ar[$1]+=$2}' A
  2. ENSMUSG00000000001 0 190
  3. ENSMUSG00000000001 191 343
  4. ENSMUSG00000000002 0 129
  5. ENSMUSG00000000003 0 128
  6. ENSMUSG00000000003 129 285
  7. ENSMUSG00000000003 286 426
  8. ENSMUSG00000000004 0 42
  9. ENSMUSG00000000004 43 159
  10. ENSMUSG00000000004 160 246
  11. ENSMUSG00000000004 247 2569
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發(fā)表于 2013-12-10 10:25 |只看該作者
  1. awk 'a!=$1{print $1,0,$2;b=0}a==$1{print $1,b+1,b+$2}{a=$1;b+=$2}' file
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發(fā)表于 2013-12-10 10:26 |只看該作者
  1. awk '!a[$1]{a[$1]=$2;print $1" "0" "$2;next} a[$1]{s=a[$1]+1;a[$1]+=$2;print $1" "s" "a[$1]}' i
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