Ubuntu 6.06安裝MPICH（采用基于密鑰的ssh認(rèn)證）

JJCH

                               
1.linux安裝
采用ubuntu 6.06.1 LTS 版本。
2.創(chuàng)建NFS服務(wù)
  sudo apt-get install nfs-common nfs-kernel-server
在服務(wù)器節(jié)點(diǎn)/home目錄下建立mpi目錄，并將其配置成NFS服務(wù)器，在/etc/exports
文件中加入一行：
  /home/mpi  node1(rw)  node2(rw)
在客戶端節(jié)點(diǎn)的/etc/fstab文件中增加一行：
  node1:/home/mpi /home/mpi nfs  rw,bg,soft  0 0
將/home/mpi這個(gè)目錄從服務(wù)器節(jié)點(diǎn)輸出，并裝載在各客戶端的/home/mpi目錄下，從而便于在各節(jié)點(diǎn)間分
發(fā)任務(wù).

3.修改/etc/hosts文件，將所有節(jié)點(diǎn)名稱極其ip地址填入。例如：
  127.0.0.1　localhost.localdomain localhost
  219.242.255.161　node1
  219.242.255.162　node2
  ......................
每個(gè)節(jié)點(diǎn)都進(jìn)行類似的配置。這樣做的目的是使節(jié)點(diǎn)之間能夠通過node1 ... noden的名
稱相互訪問。你可以通過ping noden 或 ssh noden進(jìn)行測試。

4.安裝配置ssh
  sudo apt-get install openssh-client openssh-server
以設(shè)定的用于啟動mpi計(jì)算的用戶登錄，運(yùn)行
  ssh-keygen -t rsa    #對于所有提示直接回車即可
這將生成一個(gè)密鑰對，分別存放在~/.ssh/id_rsa和~/.ssh/id_rsa.pub文件內(nèi)。
然后進(jìn)行訪問授權(quán)，運(yùn)行：
  cp ~/.ssh/id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys
  chmod go-rwx ~/.ssh/authorized_keys
  ssh-agent $SHELL
  ssh-add
在每個(gè)節(jié)點(diǎn)重復(fù)一遍。收集所有節(jié)點(diǎn)下的authorized_keys文件，合并為一個(gè)authorized_keys，然后再分發(fā)到每個(gè)節(jié)點(diǎn)的$HOME/.ssh目錄下去。
試著在某一節(jié)點(diǎn)上登錄所有節(jié)點(diǎn)（包含自身），ssh noden，則在$HOME/.ssh/下生成一個(gè)名為known_hosts的文件，里面放著訪問該主機(jī)的身份指紋，也在各個(gè)節(jié)點(diǎn)上將known_hosts文件作同樣的拷貝。
以上的目的是使各節(jié)點(diǎn)相互之間訪問無需輸入密碼。
5.開啟各項(xiàng)必需的服務(wù)
  ssh
  nfsd
  networking
6.在各節(jié)點(diǎn)編譯、安裝mpich2.(詳情參考安裝文檔)
  ./configure --prefix=/usr/local
  make
  make install
7.配置
  在$HOME目錄下執(zhí)行
   touch ~/.mpd.conf
  在里面輸入
   secretword=  #為任意你所想填寫的字符串，如"mysecret"
  再執(zhí)行
   chmod 600 ~/.mpd.conf
  編寫一個(gè)mpd.hosts文件，內(nèi)容如下：
   node1  #集群中各節(jié)點(diǎn)名,一行一個(gè)
   node2
   ......  
  
8.測試安裝是否正確
   mpdboot -n number -f mpd.hosts  #number為要啟動的節(jié)點(diǎn)數(shù)，mpd.hosts為包含機(jī)器名的文件
   mpdtrace                        #查看已啟動的節(jié)點(diǎn)
   mpdallexit                      #所有節(jié)點(diǎn)退出
   
  拷貝/usr/local/share/examples_graphics下的用例到其他目錄，編譯cpi.c:
   mpicc -o cpi cpi.c
  再執(zhí)行：
   mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
   mpiexec -n 2 cpi
  將會獲得如下信息
   Process 0 on node1
   Process 1 on node2
   ..................
  單機(jī)上模擬多節(jié)點(diǎn)可以用如下方式：
   mpd&   #啟動mpi任務(wù)管理服務(wù),只啟動本節(jié)點(diǎn)的mpd
   mpiexec -n 2 cpi
  如果都能正常運(yùn)行即證明集群環(huán)境安裝成功。
  

               
               
               
               

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