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  • iamline 發(fā)表了新話題 10-13 10:25
    awk計數(shù)問題
    本人有兩個文件, 區(qū)間文件region, 待計數(shù)的文件results.bed: more region more results.bed 根據(jù)坐標關聯(lián)2個文件,如果results.bed行的$2、$3落 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 6-17 18:15
    虛擬機安裝CentOS7后 重啟卡住了
    如題,我在虛擬機安裝CentOS7后,屏幕提示重啟,但一直卡在這個界面: 求大蝦幫忙看看,有沒有出現(xiàn)類似的問題?
  • iamline 發(fā)表了新話題 4-16 11:59
    去除重復字段,重復字段不一定緊挨著
    如題,想去除文件行中多余的重復字段,這些重復字段不一定相鄰。 例如: LOC_Os01g01040 GO:0008150,GO:0003674,GO:0008150,GO:0003674,GO:0008150,GO:0003 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 2-14 13:23
    awk挑取目標信息
    我有一個文件,如下:想進行如下處理:以$1為key(同一個key一般有多行),key相同時比較$3(信息列),如果$3不是hypothetical protein,則輸出每個key的第一個 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 1-23 10:17
    精神急救啊 awk
    最近碰到一個awk的問題,完全顛覆了我對awk的世界觀,以往總是覺得awk無往不利,迎頭向前,但現(xiàn)在被人問到一個很簡單的文件處理問題,竟然把我弄倒了,試了很多次 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 9-24 17:56
    刪除匹配的字符序列和其對應的質量序列
    dna測序的序列文件如下所示: more seq.file………… 即所謂的fastq格式,每4 行信息代表一條測序的序列,第一行和第三行表示序列名稱和ID(其中,第一行以 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 9-11 14:53
    計算一行內某幾列的和,作為新的列
    我們用awk求和,若是對某一列求和,一般是sum+=$i,然后輸出sum; 但若是要計算行的和呢?假設文件有N行,10列,想計算這10列的和,作為新的$11,每行 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 8-27 11:38
    比較上下行
    用awk是如何比較上下行的呢? 假設一個文件,總共有12列,如果有前后幾行的$1和$10都是一樣的,就進行接下來的各種處理(即對這幾行同時進行處理),但是不知 ...
  • iamline 發(fā)表了新話題 8-7 23:06
    刪除文本行
    用awk如何刪除匹配行及其后3行文本呢?各位大俠指導一下。
  • iamline 發(fā)表了新話題 8-6 10:50
    輸出匹配行的前后幾行
    如何同時輸出匹配行的前1行和后3行?我用awk只懂得輸出匹配的后3行: more file | awk '{if($0 ~/^@HIT/){ getline; if(substr($0,1,3) ~/ABC/){prin ...

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